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医学图像
2024/4/12 5:12:38
【论文笔记】WSAL：基于域适应和生成对抗网络的图像分割模型
本文是论文《Weakly Supervised Adversarial Domain Adaptation for Semantic Segmentation in Urban Scenes》的阅读笔记。 在以往的语义分割由于像素级人工标注信息较难获得，并且可能并不准确，所以有些模型采用在生成的数据集上进行训练，然…
20230222 【梳理】肿瘤检测 预处理+ML+DL
一、预处理 1、形态学【使图像中的重要部分更加可见，并消除MRI图像的琐碎部分。】 形态学操作是一种非线性操作，涉及在二值图像上移动一个窗口(或结构元素)，以一种方式帮助增长图像(膨胀)或缩小图像(侵蚀)[30]。这种预处理技术更有用，特别是当MRI图像中存在不需要
Matlab中批读取DCM文件
Matlab中批读取DCM文件1. 利用cd读取路径2. 利用dir读取文件夹的文件名3. 代码1. 利用cd读取路径
cd Change current working directory.cd directory-spec sets the current directory to the one specified.cd .. moves to the directory above the current one.cd, by …
SCI 2区论文：医疗保健中心训练有素的脑膜瘤分割模型的性能测试-基于四个回顾性多中心数据集的二次分析
基本信息
标题：Performance Test of a Well-Trained Model for Meningioma Segmentation in Health Care Centers: Secondary Analysis Based on Four Retrospective Multicenter Data Sets中文标题：医疗保健中心训练有素的脑膜瘤分割模型的性能测试&am…
面向医学图像分析的深度学习研究方案
面向医学图像分析的深度学习研究方案 这是一篇有关“深度学习在医学图像处理方面”的研究报告的第一节，主要包含研究对象，常用方法，深度学习简介，研究现状，研究重点。 在撰写报告时，我找到了两篇 Deep lea…
Vosviewer的安装与使用
Vosviewer的安装与使用 1 安装2 使用参考： 关于vosviewer我就不过多介绍了。 vosviewer与citespace有什么区别?在这里可以引用一下知乎的文章简要说明一下：
1.操作难易VOSviewer很简单，在官网下载的时候会附带一个英文手册，稍微…
Python计算DICOM图像两点真实距离
Python计算DICOM图像两点真实距离 对比测量结果图Code对比测量结果图
DICOM阅读器(小赛看看)测量结果 python测量结果
Code
import numpy as np
import cv2
import math
import pydicom
from pydicom.pixel_data_handlers.util import convert_color_spaceds = pydicom.dc…
Zotero配合dblp文献库免费一键下载文献及管理教程
Zotero配合dblp文献库免费一键下载文献及管理教程 1 dblp计算机科学文献库2 文献导入到Zotero教程参考： 在这里，相信大家都已经知道Zotero这个强大的文献管理软件了，它可以多端同步，自动下载文献，自定义标签࿰…
医学图像处理相关代码分享
github链接为：https://github.com/zuzhiang/MedicalImageProcess
数据很杂，就懒得逐一整理了，很多都是实验性的，可能存在问题，不过好久没弄也忘得差不多，有问题的话还请大家自行阅读代码解决吧，…
windows DCMTK编译使用(qt) 医学图像
由于项目需要生成DICOM格式的图片，需要使用到第三方开源库DCMTK，于是研究了一番，该库是C编写的，DICOM主要用于医疗体系中，除了可以保存图片信息外，还可以储存患者信息，病例信息，医疗…
常见的医学影像数据格式及其读取与保存
常见的医学影像数据格式及其读取与保存
1. 医学图像 医学图像是反映解剖区域内部结构或内部功能的图像，它是由一组图像元素——像素（2D） 或立体像素（3D） 组成的。医学图像是由采样或重建产生的离散性图像表征…
pytorch学习-2：变量（Variable）和激励函数
1. 变量 (Variable)
1.1 什么是 Variable
在 Torch 中的 Variable 就是一个存放会变化的值的地理位置. 里面的值会不停的变化. 就像一个裝鸡蛋的篮子, 鸡蛋数会不停变动. 那谁是里面的鸡蛋呢, 自然就是 Torch 的 Tensor 咯. 如果用一个 Variable 进行计算, 那返回的也是一个同…
BART 并行成像重建：ESPIRiT 重建（两组ESPIRiT maps）
本文主要比较使用两组ESPIRiT map进行重建和传统SENSE 重建的结果。
目录
1 SNESE重建 （使用 coil sensitivity mp）
2 ESPIRiT 重建 （使用两组ESPIRiT maps）
3 两种重建结果展示
4 结论
初识：心血管磁共振(CMR)成像
一. 什么是CMR
1.1 定义
心血管磁共振成像 （CMR）， 俗称心脏MRI :
是一种评估心血管系统的功能与结构的一种非侵入式医学成像技术。它运用磁共振成像(MRI)基本原理，针对心血管系统成像的特殊困难，优化现有的MRI成像技…
医学图像 | DualGAN与儿科超声心动图分割 | MICCAI
文章转自微信公众号：「机器学习炼丹术」 作者：炼丹兄（已授权） 联系方式：微信cyx645016617（欢迎交流共同进步） 论文名称：“Dual Network Generative Adversarial Networks for Ped…
ubuntu20下使用 torchviz可视化计算图
安装 torchviz：
pip install torchviz示例代码：下面是一个简单的示例代码，展示如何使用 torchviz 可视化计算图：
python
import torch
from torchviz import make_dot# 创建一个简单的模型
model torch.nn.Sequential(torch.nn…
MONAI-model zoo简要介绍
MONAI Medical Open Network for AI)是一个基于PyTorch开发的医学影像人工智能框架。MONAI提供了许多预先训练好的模型，这些模型可以直接在不同的医学影像数据集上进行微调和预测，避免了从头开始训练模型的麻烦。
MONAI中的model zoo包括了一系列2D和3D…
BART non-Cartesian 重建：并行成像 压缩感知
本文主要使用并行成像和压缩感知方法实现non-Cartesian MRI 数据的重建。
目录
1 自定义MRI kspace trajectory
2 自定义该 trajectory下的多通道MRI数据
3 使用NUFFT 直接做欠采样数据的重建
BART 并行成像重建： ESPIRiT/SENSE 重建 （一组ESPIRiT map）
本文主要使用bart工具包，实现ESPIRiT重建方法。
目录
1 加载多通道欠采样数据
2 计算calibration 区域的奇异值分解
3 计算calibration区域的第一组 ESPIRiT maps
根据脑图谱获取感兴趣区域的mask
根据脑图谱获取感兴趣区域的mask 1，引入1.1 ASPECT-Atlas 2，获取脑图谱感兴趣区域mask参考： 1，引入
脑影像分析中，我们常常会针对性的对某些感兴趣区域进行分析，而对它们进行分析的前提是获取该区域的mask…